Область научных интересов А.Е. Загребина включает в себя историю этнографии финно-угорских народов, проблемы модернизации удмуртской культуры в XIX-XX вв., городскую этносоциологию, теорию и практику полевой этнографической работы.
А.Е. Загребин является членом Финно-Угорского Общества (Финляндия), членом Общества М.А. Кастрена (Финляндия), членом Президиума Ассоциации историков-финно-угроведов, Председателем регионального комитета финно-угроведов и членом Комитета финно-угроведов РФ, членом Российского общества интеллектуальной истории, членом Исполкома Ассоциации этнографов и антропологов России, членом редколлегии научного журнала «Вестник Удмуртского университета». Серия: история и филология, Председателем редакционного совета научного альманаха «Ежегодник финно-угорских исследований», исполнителем и руководителем проектов РГНФ и программ Президиума РАН и УрО РАН; автором более 100 научных и учебно-методических работ.
